瓶裝啤酒的“冷芯”實驗表明，在快速加熱瓶裝啤酒時，不可能均勻地加熱瓶中的啤酒。熱交換是通過傳熱性能較差的玻璃表面進行的。要開始加熱，首先要加熱瓶子的外面，但里面的啤酒仍然是冷的。只要瓶子最冷部分的冷芯溫度不升高，也可以加熱到所需的殺菌溫度，達到規定的巴氏殺菌單元。否則不能完成整瓶的加熱。冷芯位于瓶底向上 1.5 米處。
巴氏殺菌的測量點和記錄受到溫度處理的限制，這會在瓶子內產生流動截面，導致容器內各個點的溫度分布和滅菌單位不一致。為此，采用容器內部的兩個基準點來測量表觀殺傷面單元，該單位位于容器的中軸線和容器底部1/3的高度上。第二個是最低溫度點，位于容器的中心軸，距離底部8~10mm。由于該側點基本上不受容器內部流動的影響，加熱時該點的溫度最低。這樣就可以通過帶有測溫點的瓶子準確測量殺菌機各溫度區的溫度。具體方法是將測得的瓶裝酒放入儀器中，放入殺菌機，其他瓶酒通過殺菌機，殺菌后取出儀器記錄，直接從記錄中得到PU值桌子。現代巴氏殺菌機使用計算機和顯示器來監控巴氏殺菌溫度。他們記錄了每個溫區的最高溫度、瓶子中的實際溫度以及實際達到的巴氏殺菌單位。
隧道滅菌器溫度的精確控制極為重要，一方面要實現瓶子的徹底滅菌；另一方面，盡量減少水和熱能的消耗。

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